La Roma ha riscattato Marquinho. La società giallorossa, attraverso un comunicato, ha ufficializzato il buon esito dell'affare con la Fluminense, nelle cui casse saranno versati 3,5 milioni di euro pagabili in due rate, "la prima, pari a 2 milioni di euro, entro il 10 luglio 2012, e la seconda, pari a 1,5 milioni di euro, entro e non oltre il 10 luglio 2013", si legge nella nota.
Contestualmente il centrocampista brasiliano ha firmato un contratto fino al 30 giugno 2016. Prelevato a gennaio, Marquinho ha disputato un'ottima seconda parte di stagione in Serie A, realizzando tre gol in 12 presenze.