Dopo Le Mans, Silverstone e Assen, tocca al Mugello ospitare il brutto tempo: sotto una pioggia battente è Andrea Dovizioso che ottiene il miglior tempo delle seconde libere. Il pilota della Repsol Honda è il più rapido. Approfittano del brutto tempo anche Toni Elias, secondo a più di due secondi e soprattutto Valentino Rossi che ottiene il terzo tempo a più di tre secondi. Per il "Dottore" i problemi non sono finiti, un cavo elettrico andato in corto circuito e una centralina difettosa hanno fatto spegnere sia la prima moto che il muletto, la Ducati oltre alla pioggia deve fare i conti con l'affidabilità.
Non scendono neanche in pista invece Jorge Lorenzo, Casey Stoner, Dani Pedrosa e Marco Simoncelli che preferiscono non rischiare.
Di seguito i tempi delle seconde libere:
Pos. Pilota Nazione Tempo
1 DOVIZIOSO Andrea (ITA) in 0h01'49''272
2 ELIAS Toni (SPA) + 00:00:02.665
3 ROSSI Valentino (ITA) + 00:00:03.278
4 BAUTISTA Alvaro (SPA) + 00:00:05.225
5 DE PUNIET Randy (FRA) + 00:00:06.007
6 ABRAHAM Karel (CZE) + 00:00:09.062
7 BARBERA Hector (SPA) + 00:00:09.476
8 CRUTCHLOW Cal (GBR) + 00:00:10.540
9 HAYDEN Nicky (USA) + 00:00:17.114
10 AOYAMA Hiroshi (JPN) + 00:00:20.065
11 EDWARDS Colin (USA) + 00:00:20.754
12 SPIES Ben (USA) + 00:00:37.666
13 LORENZO Jorge (SPA) NON PARTITO
14 PEDROSA Dani (SPA) NON PARTITO
15 STONER Casey (AUS) NON PARTITO
16 SIMONCELLI Marco (ITA) NON PARTITO
