Nel terzo turno delle prove libere Casey Stoner ottiene il primo tempo con 2.07.321. Nel Gp della Repubblica Ceca, valido per la 12esima prova del Mondiale, l'australiano precede il campione del mondo Jorge Lorenzo e, a sorpresa, la Ducati di Valentino Rossi. Il dottore è stato agevolato dalla pioggia che batte sul circuito di Brno, con la condizione umida della pista che ha aiutato la moto di Borgo Panigale ad accorciare le distanze con i piloti normalmente più veloci. Dopo Rossi, il migliore degli italiani, in ottava posizione ecco Andrea Dovizioso. Solo nono Marco Simoncelli, mentre Lorisi Capirossi chiude al 14esimo posto.
